外源核酸诱导的Ago(Crt-SPARTA)系统激活分子机制，PCR-Clean助力科研

近日，一项新的研究结果，为新型基因编辑，基因检测技术以及药物研发提供了重要理论支撑。基因编辑技术，需要对遗传物质进行精准的操控，因此需要严格控制实验环境中的核酸污染。德国MB公司生产的核酸污染祛除试剂——PCR Clean，即用型喷雾，可直接喷洒在待清洁物品表面，高效清除核酸污染。

Argonaute (Ago)介导RNA或DNA引导的核酸抑制。虽然真核生物(eAgos)和长原核生物Ago (pAgos)蛋白的机制是已知的，但短pAgos的机制仍然是难以捉摸的。

近日，科研人员确定了来自Crenotalea thermophila (Crt)的短pAgo和相关的TIR- apaz蛋白(SPARTA)的低温电镜结构:一个自由状态的rt-SPARTA (3.27 Å)，一个装载引导RNA /靶DNA的rt-SPARTA (3.27 Å)，两个具有不同TIR组织的rt-SPARTA二聚体(3.49 Å和3.50 Å)，以及一个rt-SPARTA四聚体(3.41 Å)。

相关研究发表在《Nature》上，文章标题为：“Nucleic acid-triggered NADase activation of a short prokaryotic Argonaute"。

该项研究中的结构，揭示了ct - sparta是由连接TIR叶的双叶折叠Ago叶组成的。rt- ago含有MID和PIWI结构域，而rt-TIR- apaz含有TIR、N-like、Linker和Trigger结构域。结合的RNA/DNA双链采用b型构象，可被碱基特异性接触识别。核酸结合导致构象变化，因为触发器作为一个障碍，阻止引导RNA 5 ' -和目标DNA 3 ' -末端到达它们的规范口袋，这扰乱了MID结构域并促进了rt- sparta二聚化。两个RNA/ dna负载的rt- sparta二聚体通过它们的TIR结构域形成一个四聚体。四个Crt-TIR组装成两个平行的，头尾相连的TIR组织，表明nadase活性构象。

该项研究结果揭示了短pAgos防御入侵核酸的结构基础，并为优化基于sparta的可编程DNA序列检测提供了见解。