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蛋白质相分离引发过氧化物酶体的生物发生过程,德国MB助力科研

更新时间:2023-05-16  |  点击率:500

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过氧化物酶Pex5Pex13Pex14在过氧化物酶体靶向信号1 (PTS1)通路的蛋白易位步骤中起关键作用。Pex5通过识别PTS1基序(羧基端三肽序列丝氨酸-赖氨酸-亮氨酸(SKL)或其变体)与细胞质中的货物蛋白结合。货物结合时的构象改变暴露了一个内在无序区(IDR),该区域与过氧化物酶体膜蛋白Pex13Pex14相互作用,导致货物蛋白易位到过氧化物酶体基质。

 

在过氧化物酶体中没有观察到通道结构,也没有验证过运输的物理模型,但提供了一些证据,证明至少是瞬时形成的通道。在一项体外研究中,用Pex14复合物重建的脂质膜在直径达9纳米的货物中显示出pex5 -货物依赖的离子电导。

 

Pex5Pex13Pex14idr的序列特征类似于核孔复合物(npc)的核孔蛋白,这为可能的转运机制提供了线索。值得注意的是,Pex13在其IDR中具有一系列Tyr-Gly (YG)重复序列。

 

研究人员推断这些残基可能通过π -ππ -阳离子相互作用发生LLPS,类似于核孔蛋白中ph - gly (FG)重复序列形成的LLPS,并构成NPC的选择性渗透性过滤器;我们假设产生的凝聚形成了一个简单的、原始的、瞬态的类似npc的集合。

 

相关研究发表在《Nature》上,文章标题为“Peroxisome biogenesis initiated by protein phase separation"。

 

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这一假设为蛋白质进入过氧化物酶体提供了一种自然的解释,过氧化物酶通过LLPS形成生物分子凝聚物,并为货物通过过氧化物酶体膜运输创造了一个短暂的管道,Pex5类似于核细胞蛋白充当穿梭受体。出芽酵母酵母S. cerevisiae Pex13在其IDR中具有芳香重复序列,Pex5Pex13在其IDR中具有明显的朊病毒样结构域(PLDs),这些结构域已被证明通过多价π -ππ -阳离子贴纸"相互作用形成生物分子凝聚物。

 

事实上,在ATP耗竭的情况下,过氧化物酶体蛋白以大型复合物的形式沉淀,这表明它们的形成先于易位。因此,研究人员开始验证过氧化物酶体蛋白转运通过Pex5-cargo-Pex13-Pex14 LLPS发生的假设。

 

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