肺的空间分辨图谱展示了腺体相关的免疫生态位 ,MB产品助力科研

全面了解界定肺功能的细胞和微环境对于减少肺部疾病的影响非常重要，目前肺部疾病在全球死亡原因中占比明显。肺除了主要的气体交换功能外，还有重要的屏障功能。虽然其他粘膜屏障组织通过明确的粘膜相关淋巴组织(MALT)调节适应性免疫，但在健康人类肺部尚未报道这种次级淋巴结构。LungMAP和人类肺细胞图谱(HLCA)联盟利用了单细胞和单核RNA测序(scRNA-seq和snRNA-seq)的最新进展，并生成了许多描述跨物种、健康和疾病的肺细胞类型的图谱。

目前的图谱优先考虑实质组织，很少有研究检查气道的全深度。研究人员从死亡器官捐赠者的健康肺和气道中进行了深层组织分析，允许沿着呼吸树的近端到远端轴描述细胞类型。

相关研究发表在《Nature Genetics》上，文章标题为：“A spatially resolved atlas of the human lung characterizes a gland-associated immune niche"。

研究人员使用无偏空间转录组学(ST)方法，在健康人类肺和气道的组织微环境中对细胞类型和状态进行背景分析，为HLCA添加了一个关键维度。

总的来说，共测序了129,340个单细胞和63,768个单核，并对来自人类气管、支气管和上下薄壁的20个组织切片进行了Visium ST。这些数据和CellTypist自动注释模型可在lungcellatlas.org上获得，作为数据下载、悬浮和空间基因表达分析的资源，以及新数据集的自动注释。

研究人员区分了80种细胞类型和状态，其中包括11种在以前的肺图谱研究中未注释的细胞群。这些人群中许多表达功能性全基因组关联研究(fGWAS)分析突出的疾病相关基因。我们深入的组织分析与空间基因组学结合，在全分子宽度上重建了肺和气道中的已知组织微环境。超越已知的细胞组织单位，我们在气道粘膜下腺(SMG)确定了IgA浆细胞先前未定义的免疫生态位。

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