目前在市场上,有一款支原体qPCR检测试剂盒(英文品名:Venor®Gem qEP,厂家:德国MB) 广受药厂的欢迎。
该试剂盒经过全面的方法学验证,符合欧洲药典和日本药典要求,适合细胞治疗、CAR-T、抗体药、疫苗等药厂的过程控制、放行检测以及临床申报。要用好该试剂盒,除了严格遵循说明书的操作外,还有些注意事项,下面小编向您介绍一下。
一、仪器的设置
要注意你所用的qPCR仪有几个通道,是否可检测相应的荧光素。
MB的支原体qPCR检测试剂盒(英文名:Venor®Gem qEP)适用的荧光定量PCR仪的机型广泛,相关设置可从缔一生物网站下载。
二、基线设置
许多qPCR仪软件有自动基线设置功能。
但要注意,有时也需要查看原始荧光数据,了解各个样本的基线水平。
如下图图1,有一些样本的基线水平较高,就提示这些样本可能存在一定的数据偏差或操作错误。
图1. 基线校正前的曲线
三、阈值设置
许多qPCR仪软件有自动阈值设置功能。但也应关注一下,仪器自动设定的阈值线是否合适。这需要一定的经验。
如果阈值设定太低,会使灵敏度**化,增加假阳性的可能;
如果阈值设定太高,可能会影响灵敏度并导致假阴性。
图2和图3就是一个例子。
图2. ABI 7500自动阈值的设定。
图3. ABI 7500手动阈值的设定(荧光**值的5%)
在图2中,有2个样本为支原体阳性(黄线和红线)。
在图3中,这2个样本中有一个变为阴性了(红线)。
总之,阈值设定,如果是软件自动设置,应再看一下阈值线的位置是否合适。必要时可进行手动设置。