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PCRdi检出限刍议

更新时间:2020-11-17  |  点击率:907

现在,PCR试剂盒常用于各种检测。其中di检出限是PCR试剂盒一个重要的参数。PCRdi检出限就是所能检测到的靶标的di值。di检出限的确定应通过定量标准品来完成。定量标准品一般是经过严格标定拷贝数的阳性DNA,梯度稀释后进行一系列的检测,每个梯度做8个复孔,终确定条带能否观测到或确定Ct值。

 示例. PCR定量标准品(支原体)(Minerva Biolabs

接着可用Reed-Muench公式计算方法的检测限(LOD50),lgLOD50=距离比例×稀释对数质检的差+高于50%检出率的稀释度的对数。距离比例=(高于50%检出率的百分数-50%/(高于50%检出率的百分数-低于50%检出率的百分数)。也可使用Excel软件在回归分析中,自动计算LOD值(Data>Data Analysis>Regression,选中XY值)

PCRdi检出限相当于方法的灵敏度,它与DNA模板的质量(包括是否有杂质)、整个PCR反应体系的性能优化(包括反应缓冲液、酶的功能、引物序列、引物浓度)、PCR程序条件的设定都有关系。有人采用巢式PCR,的确使得方法的灵敏度更高,但同时也增加了反应的复杂性和反应时间。

总之,PCR具有足够低的检测限,才能保证不会发生漏检。因此,在方法学意义上,di检测限应受到足够的重视。

参考文献:

  1. Armbruster, D.A., Pry T. Limit of blank, limit of detection and limit of quantitation. Clin. Biochem. Rev. 29, Suppl 1 (2008).
  2. Ripp, J., Analytical Detection Limit Guidance & Laboratory Guide for Determining Method Detection Limits, Wisconsin Department of Natural Resources, Laboratory Certification Program, 1996. 
  3. Shrivastava, A., Gupta, V. Methods for the determination of limit of detection and limit of quantitation of the analytical methods. Chronicles Young Sci. 2, 1 (2011). doi:10.4103/2229-5186.79345.
  4. Desimoni, E., Brunetti, B. About Estimating the Limit of Detection by the Signal to Noise Approach. Pharm. Anal. Acta. 6, 4 (2015). doi:10.4172/2153-2435.1000355.

 

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