PCRdi检出限刍议
更新时间:2020-11-17 | 点击率:907
现在,PCR试剂盒常用于各种检测。其中di检出限是PCR试剂盒一个重要的参数。PCRdi检出限就是所能检测到的靶标的di值。di检出限的确定应通过定量标准品来完成。定量标准品一般是经过严格标定拷贝数的阳性DNA,梯度稀释后进行一系列的检测,每个梯度做8个复孔,终确定条带能否观测到或确定Ct值。
示例. PCR定量标准品(支原体)(Minerva Biolabs)
接着可用Reed-Muench公式计算方法的检测限(LOD50),lgLOD50=距离比例×稀释对数质检的差+高于50%检出率的稀释度的对数。距离比例=(高于50%检出率的百分数-50%)/(高于50%检出率的百分数-低于50%检出率的百分数)。也可使用Excel软件在回归分析中,自动计算LOD值(Data>Data Analysis>Regression,选中X,Y值)
PCRdi检出限相当于方法的灵敏度,它与DNA模板的质量(包括是否有杂质)、整个PCR反应体系的性能优化(包括反应缓冲液、酶的功能、引物序列、引物浓度)、PCR程序条件的设定都有关系。有人采用巢式PCR,的确使得方法的灵敏度更高,但同时也增加了反应的复杂性和反应时间。
总之,PCR具有足够低的检测限,才能保证不会发生漏检。因此,在方法学意义上,di检测限应受到足够的重视。
参考文献:
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